Spy x Family ini bercerita tentang Untuk agen yang dikenal sebagai “Tasogare (Senja)”, tidak ada perintah yang mustahil jika itu demi perdamaian. Beroperasi sebagai mata-mata utama Westalis, Tasogare bekerja tanpa lelah untuk mencegah para ekstremis memicu perang dengan negara tetangga, Ostania. Untuk misi terakhirnya, ia harus menyelidiki politisi Ostanian, Donovan Desmond, dengan menyusup ke sekolah putranya: Akademi Eden yang bergengsi. Dengan demikian, sang agen menghadapi tugas tersulit dalam karirnya: dimana dia harus menikah, punya anak, dan bermain keluarga-keluargaan. Tasogare, atau “Loid Forger,” dengan cepat mengadopsi anak yatim piatu sederhana bernama Anya untuk memainkan peran sebagai putri berusia enam tahun dan calon siswa Akademi Eden. Untuk seorang istri, ia menemukan Yor Briar, seorang pekerja kantoran yang sedikit kikuk yang membutuhkan pasangan pura-pura untuk mengesankan teman-temannya. Namun, Loid bukan satu-satunya yang memiliki sifat tersembunyi. Yor sebenarnya adalah pembunuh mematikan dengan julukan “Ibarahime (Putri Duri).” Baginya, menikahi Loid dapat menjadi kedok yang sempurna. Sementara itu, Anya bukanlah gadis biasa seperti yang terlihat; dia adalah seorang esper, produk dari eksperimen rahasia yang memungkinkannya membaca pikiran. Meskipun dia mengungkap identitas asli mereka, Anya senang bahwa orang tua barunya adalah agen rahasia yang keren! Tentu saja dia tidak akan pernah memberitahu mereka, karena itu akan merusak kesenangannya. Dengan kedok sebagai “Keluarga Forger,” mata-mata, pembunuh, dan esper ini harus bertindak sebagai keluarga sambil menjalankan agenda mereka masing-masing. Meskipun para pembohong dan orang aneh ini hanya melakukan perannya, mereka segera menyadari kalau keluarga lebih dari sekadar hubungan darah.